389 पेपर
यह अध्ययन प्रकट करता है कि पेपरड मॉथ (peppered moth) में औद्योगिक मेलानिज़्म (industrial melanism) ब्रिटेन और महाद्वीपीय यूरोप में एक ही *इवरी* (ivory) लोकस पर अलग-अलग संरचनात्मक वेरिएंट्स के माध्यम से स्वतंत्र रूप से विकसित हुआ, जो यह दर्शाता है कि समानांतर अनुकूलन एक ही जीन के भीतर कई अलग-अलग उत्परिवर्तनों से उत्पन्न हो सकता है।
उच्च-रिज़ॉल्यूशन वाले भू-आकृतिक डेटा को समुद्र के स्तर के मॉडलों के साथ एकीकृत करके, यह अध्ययन पनामा के बोकास डेल टोरो द्वीपसमूह के सहस्राब्दी-स्तर के विकास का पुनर्निर्माण करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि द्वीपों के क्रमिक अलगाव और आवास के उतार-चढ़ाव का इसका अनूठा इतिहास स्थलीय जैव विविधता के पैटर्न को कैसे संचालित करता है, जबकि जलवायु परिवर्तन के तहत उथले समुद्री आवासों में महत्वपूर्ण भविष्य के बदलावों का अनुमान भी लगाता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि विविध प्राइमेट वंशों में एमाइलेज अभिव्यक्ति का अभिसारी विकास (convergent evolution) रेट्रोट्रांसपोज़न सम्मिलन और गैर-एलीलिक होमोलॉगस पुनर्संयोजन द्वारा संचालित स्वतंत्र जीनोमिक पुनर्व्यवस्था के माध्यम से उत्पन्न हुआ, जिससे समान कार्यात्मक परिणामों वाले विशिष्ट जीन प्रतियां प्राप्त हुईं।
यह अध्ययन *Littorina saxatilis* इकोटाइप्स का उपयोग करते हुए तीन ज्यामितीय मॉर्फोमेट्रिक विधियों—एलिप्टिकल फूरियर विश्लेषण, लैंडमार्क-आधारित ज्यामितीय मॉर्फोमेट्रिक्स, और शेलशेपर (ShellShaper) ग्रोथ मॉडल—के प्रदर्शन का मूल्यांकन करता है ताकि विशिष्ट अनुसंधान लक्ष्यों, जैसे कि हाई-थ्रूपुट स्क्रीनिंग, क्लस्टरिंग पावर, या विस्तृत शारीरिक विश्लेषण के आधार पर सबसे उपयुक्त तकनीक चुनने के लिए साक्ष्य-आधारित दिशानिर्देश प्रदान किए जा सकें।
*Malacoceros fuliginosus* के विकासात्मक, आणविक, अतिसूक्ष्म (अल्ट्रास्ट्रक्चरल) और कनेक्टोमिक विश्लेषणों को एकीकृत करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि इसकी विविध सेरेब्रल आँखें होमोलॉगस (समजात), इनवर्टेड रॅबडोमेरिक संरचनाएँ हैं जो संभवतः एक पूर्वज डुप्लीकेशन घटना से उत्पन्न हुई थीं, जो एनेलिड (annelid) नेत्र विकास को समझने के लिए एक एकीकृत ढांचा प्रदान करती हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि *E. coli* की आबादी में आवृत्ति-निर्भर फिटनेस प्रभाव सर्वव्यापी हैं, जो निरंतर चयन की धारणा को चुनौती देते हुए यह प्रकट करते हैं कि उत्परिवर्तित आवृत्ति बढ़ने के साथ प्रतिस्पर्धी लाभ आमतौर पर घटते हैं और ये गतिकी विकासवादी प्रक्षेपवक्रों को महत्वपूर्ण रूप से परिवर्तित करती हैं।
यह अध्ययन व्यापक जीनोमिक विश्लेषणों का उपयोग करके यह प्रकट करता है कि व्यापक रूप से अध्ययन किए गए सीनोफोर (ctenophore) *Mnemiopsis leidyi* में वास्तव में दो विशिष्ट गुप्त प्रजातियां, *M. leidyi* और *M. gardeni* शामिल हैं, जो प्लेइस्टोसीन (Pleistocene) के दौरान अलग हुई थीं और अमेरिकी अटलांटिक तट के साथ जीनोमिक पुनर्गठन एवं पर्यावरणीय अनुकूलन द्वारा आकार लेती हैं।
अफ्रीका और अमेरिका की *एडीज एजिप्टी* (Aedes aegypti) आबादी का विश्लेषण करने के लिए मशीन लर्निंग का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि हार्ड स्वीप्स (hard sweeps) की तुलना में सॉफ्ट स्वीप्स (soft sweeps) प्रमुख हैं, जो कीटनाशकों जैसे पर्यावरणीय तनावों के प्रति मच्छर की तीव्र अनुकूलन क्षमता को दर्शाता है और वेक्टर नियंत्रण के लिए महत्वपूर्ण विशिष्ट प्रतिरोध जीन को उजागर करता है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि सिलियेट *पैरामीशियम सोनेबोर्नी* ने अंतर-प्रजाति मैथुन और जीनोमिक इंट्रोग्रेशन के माध्यम से बार-बार अत्यधिक आनुवंशिक विचलन बाधाओं को पार किया है, जो इसकी अद्वितीय परमाणु द्वैतता द्वारा सुगम होता है जो इसे दैहिक जीनोम से असंगत विदेशी डीएनए को समाप्त करने और उसे जर्मलाइन में बनाए रखने की अनुमति देता है।
यह अध्ययन एक नवीन बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन का उपयोग करते हुए जंगली घर के चूहों के पहले बड़े पैमाने के जनसंख्या जीनोमिक सर्वेक्षण को प्रस्तुत करता है, जो 1,00,000 से अधिक गैर-संदर्भित एंडोजेनस रेट्रोवायरस प्रविष्टियों (insertions) की पहचान करता है, जिससे महत्वपूर्ण उप-प्रजाति-विशिष्ट विविधता का पता चलता है और संरचनात्मक भिन्नता तथा अनुकूलन विकास में इन गतिशील तत्वों की भूमिका को रेखांकित किया जाता है, जैसे कि प्रतिरोध प्रदान करने वाले Fv4 लोकस का अनुकूलन अंतःप्रवेश (adaptive introgression)।